簡(jiǎn) 歷:
2010/07-至今,中國(guó)科學(xué)院計(jì)算技術(shù)研究所,前瞻研究實(shí)驗(yàn)室,學(xué)術(shù)主任,研究員?
2006/05-2008/08,加拿大滑鐵盧大學(xué),計(jì)算機(jī)系,訪(fǎng)問(wèn)學(xué)者?
2003/07-2010/06,中國(guó)科學(xué)院計(jì)算技術(shù)研究所,前瞻研究實(shí)驗(yàn)室,副研究員?
2001/01-2003/06,中國(guó)科學(xué)院計(jì)算技術(shù)研究所,前瞻研究實(shí)驗(yàn)室,助理研究員?
1997/09 – 2001/01,中科院計(jì)算所,博士,導(dǎo)師:李國(guó)杰研究員?
1994/09 – 1997/06,中科院計(jì)算所,碩士,導(dǎo)師:白碩研究員?
1990/09 – 1994/06,山東大學(xué),計(jì)算機(jī)系,學(xué)士?
個(gè)人主頁(yè):http://bioinfo.ict.ac.cn/~dbu/
主要論著:
期刊文章:?
[1]Chao Wang, Yi Wei, Lupeng Kong, Shiwei Sun, Wei-Mou Zheng, Dongbo Bu*,Constructing effective energy functions for protein structure prediction through broadening attraction-basin and reverse Monte Carlo sampling, BMC Bioinformatics, 2019?通訊作者?
[2]Jianwei Zhu, Sheng Wang, Dongbo Bu*, Jinbo Xu*,Protein threading using residue co-variation and deep learning, Bioinformatics, 2018, 34(13): i263~273 通訊作者?
[3]Jianwei Zhu, Haicang Zhang, Shuai Cheng Li, Chao Wang, Lupeng Kong, Shiwei Sun, Wei-Mou Zheng, Dongbo Bu*,Improving protein fold recognition by extracting fold-specific features from predicted residue–residue contacts, Bioinformatics, 2017 Dec, 33(53): 3749~3753 通訊作者?
[4]Hong Liu#, Maozhen Han#, Shuai Cheng Li, Guangming Tan, Shiwei Sun, Zhiqiang Hu, Pengshuo Yang Rui Wang, Yawen Liu, Feng Chen, Jianjun Peng, Hong Peng Hongxing Song, Yang Xia, Liqun Chu, Quan Zhou, Feng Guan, Jing Wu, Dongbo Bu*, Kang Ning*. Resilience of human gut microbial communities for the long stay with multiple dietary shifts, Gut 2018, DOI: 10.1136/gutjnl-2018-317298. 通訊作者?
[5]Shiwei Sun#, Chuncui Huang#, Yaojun Wang#, Yaming Liu, Jingwei Zhang, Jinyu Zhou, Feng Gao, Fei Yang, Runsheng, Chen, Barbara, Mulloy, Wengang Chai*, Yan Li*, Dongbo Bu*. Toward automated identification of glycan branching patterns using multistage mass spectrometry with intelligent precursor selection [J]. Analytical Chemistry, 2018, 90, 14412-14422. 通訊作者?
專(zhuān)利:?
[1]孫世偉,王耀君,卜東波,李巖,黃純翠,劉亞名,楊飛,武紅梅,陳潤(rùn)生,多級(jí)質(zhì)譜生物大分子結(jié)構(gòu)鑒定方法,201510290301.7, 已授權(quán)?
科研項(xiàng)目:
[1] 國(guó)家自然科學(xué)基金面上,31770775,蛋白質(zhì)殘基間相互作用預(yù)測(cè)算法研究及其在三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)中的應(yīng)用,60萬(wàn),在研,主持
[2] 國(guó)家自然科學(xué)基金面上,61272318,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模體識(shí)別及結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)算法研究,2012/01-2016/12,80萬(wàn),已結(jié)題,主持?
[3] 國(guó)家自然科學(xué)基金青年基金,30800168,基于隨機(jī)圖的蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)研究,2008/01-2012/12,20萬(wàn),已結(jié)題,主持?
[4] 國(guó)家自然科學(xué)基金重大項(xiàng)目子課題,非規(guī)范知識(shí)處理的關(guān)鍵技術(shù)研究, 60496320,2005/01-2009/12, 120萬(wàn),已結(jié)題,子課題負(fù)責(zé)人?
卜東波 研究員
研究方向:
所屬部門(mén):前瞻研究實(shí)驗(yàn)室、處理器芯片重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
導(dǎo)師類(lèi)別:博導(dǎo)計(jì)算機(jī)軟件與理論
聯(lián)系方式:dbu@ict.ac.cn
個(gè)人網(wǎng)頁(yè):http://www.bioinfo.org.cn/~dbu/